"cDNA cloning and functional analysis of the p97 subunit of the 26S proteasome, a polypeptide identical to the type-1 tumor-necrosis-factor-receptor-associated protein-2/55.11."
Tsurumi C. , Shimizu Y. , Saeki M. , Kato S. , DeMartino G.N. , Slaughter C.A. , Fujimuro M. , Yokosawa H. , Yamasaki M. , Hendil K.B. , Toh-e A. , Tanahashi N. , Tanaka K.
Eur. J. Biochem.239:912-921(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Cloning of human full-length CDSs in BD Creator(TM) system donor vector."
Kalnine N. , Chen X. , Rolfs A. , Halleck A. , Hines L. , Eisenstein S. , Koundinya M. , Raphael J. , Moreira D. , Kelley T. , LaBaer J. , Lin Y. , Phelan M. , Farmer A.
Submitted (2003-08) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases

"Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs."
Ota T. , Suzuki Y. , Nishikawa T. , Otsuki T. , Sugiyama T. , Irie R. , Wakamatsu A. , Hayashi K. , Sato H. , Nagai K. , Kimura K. , Makita H. , Sekine M. , Obayashi M. , Nishi T. , Shibahara T. , Tanaka T. , Ishii S. , Yamamoto J. , Saito K. , Kawai Y. , Isono Y. , Nakamura Y. , Nagahari K. , Murakami K. , Yasuda T. , Iwayanagi T. , Wagatsuma M. , Shiratori A. , Sudo H. , Hosoiri T. , Kaku Y. , Kodaira H. , Kondo H. , Sugawara M. , Takahashi M. , Kanda K. , Yokoi T. , Furuya T. , Kikkawa E. , Omura Y. , Abe K. , Kamihara K. , Katsuta N. , Sato K. , Tanikawa M. , Yamazaki M. , Ninomiya K. , Ishibashi T. , Yamashita H. , Murakawa K. , Fujimori K. , Tanai H. , Kimata M. , Watanabe M. , Hiraoka S. , Chiba Y. , Ishida S. , Ono Y. , Takiguchi S. , Watanabe S. , Yosida M. , Hotuta T. , Kusano J. , Kanehori K. , Takahashi-Fujii A. , Hara H. , Tanase T.-O. , Nomura Y. , Togiya S. , Komai F. , Hara R. , Takeuchi K. , Arita M. , Imose N. , Musashino K. , Yuuki H. , Oshima A. , Sasaki N. , Aotsuka S. , Yoshikawa Y. , Matsunawa H. , Ichihara T. , Shiohata N. , Sano S. , Moriya S. , Momiyama H. , Satoh N. , Takami S. , Terashima Y. , Suzuki O. , Nakagawa S. , Senoh A. , Mizoguchi H. , Goto Y. , Shimizu F. , Wakebe H. , Hishigaki H. , Watanabe T. , Sugiyama A. , Takemoto M. , Kawakami B. , Yamazaki M. , Watanabe K. , Kumagai A. , Itakura S. , Fukuzumi Y. , Fujimori Y. , Komiyama M. , Tashiro H. , Tanigami A. , Fujiwara T. , Ono T. , Yamada K. , Fujii Y. , Ozaki K. , Hirao M. , Ohmori Y. , Kawabata A. , Hikiji T. , Kobatake N. , Inagaki H. , Ikema Y. , Okamoto S. , Okitani R. , Kawakami T. , Noguchi S. , Itoh T. , Shigeta K. , Senba T. , Matsumura K. , Nakajima Y. , Mizuno T. , Morinaga M. , Sasaki M. , Togashi T. , Oyama M. , Hata H. , Watanabe M. , Komatsu T. , Mizushima-Sugano J. , Satoh T. , Shirai Y. , Takahashi Y. , Nakagawa K. , Okumura K. , Nagase T. , Nomura N. , Kikuchi H. , Masuho Y. , Yamashita R. , Nakai K. , Yada T. , Nakamura Y. , Ohara O. , Isogai T. , Sugano S. more...
Nat. Genet.36:40-45(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"The DNA sequence, annotation and analysis of human chromosome 3."
Muzny D.M. , Scherer S.E. , Kaul R. , Wang J. , Yu J. , Sudbrak R. , Buhay C.J. , Chen R. , Cree A. , Ding Y. , Dugan-Rocha S. , Gill R. , Gunaratne P. , Harris R.A. , Hawes A.C. , Hernandez J. , Hodgson A.V. , Hume J. , Jackson A. , Khan Z.M. , Kovar-Smith C. , Lewis L.R. , Lozado R.J. , Metzker M.L. , Milosavljevic A. , Miner G.R. , Morgan M.B. , Nazareth L.V. , Scott G. , Sodergren E. , Song X.-Z. , Steffen D. , Wei S. , Wheeler D.A. , Wright M.W. , Worley K.C. , Yuan Y. , Zhang Z. , Adams C.Q. , Ansari-Lari M.A. , Ayele M. , Brown M.J. , Chen G. , Chen Z. , Clendenning J. , Clerc-Blankenburg K.P. , Chen R. , Chen Z. , Davis C. , Delgado O. , Dinh H.H. , Dong W. , Draper H. , Ernst S. , Fu G. , Gonzalez-Garay M.L. , Garcia D.K. , Gillett W. , Gu J. , Hao B. , Haugen E. , Havlak P. , He X. , Hennig S. , Hu S. , Huang W. , Jackson L.R. , Jacob L.S. , Kelly S.H. , Kube M. , Levy R. , Li Z. , Liu B. , Liu J. , Liu W. , Lu J. , Maheshwari M. , Nguyen B.-V. , Okwuonu G.O. , Palmeiri A. , Pasternak S. , Perez L.M. , Phelps K.A. , Plopper F.J. , Qiang B. , Raymond C. , Rodriguez R. , Saenphimmachak C. , Santibanez J. , Shen H. , Shen Y. , Subramanian S. , Tabor P.E. , Verduzco D. , Waldron L. , Wang J. , Wang J. , Wang Q. , Williams G.A. , Wong G.K.-S. , Yao Z. , Zhang J. , Zhang X. , Zhao G. , Zhou J. , Zhou Y. , Nelson D. , Lehrach H. , Reinhardt R. , Naylor S.L. , Yang H. , Olson M. , Weinstock G. , Gibbs R.A. more...
Nature440:1194-1198(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)."
The MGC Project Team
Genome Res.14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Two-hybrid cloning of a gene encoding TNF receptor-associated protein 2, a protein that interacts with the intracellular domain of the type 1 TNF receptor: identity with subunit 2 of the 26S protease."
Dunbar J.D. , Song H.Y. , Guo D. , Wu L.-W. , Donner D.B.
J. Immunol.158:4252-4259(1997) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"A protein related to a proteasomal subunit binds to the intracellular domain of the p55 TNF receptor upstream to its 'death domain'."
Boldin M.P. , Mett I.L. , Wallach D.
FEBS Lett.367:39-44(1995) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks."
Olsen J.V. , Blagoev B. , Gnad F. , Macek B. , Kumar C. , Mortensen P. , Mann M.
Cell127:635-648(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Mass spectrometric characterization of the affinity-purified human 26S proteasome complex."
Wang X. , Chen C.-F. , Baker P.R. , Chen P.-L. , Kaiser P. , Huang L.
Biochemistry46:3553-3565(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Improved titanium dioxide enrichment of phosphopeptides from HeLa cells and high confident phosphopeptide identification by cross-validation of MS/MS and MS/MS/MS spectra."
Yu L.R. , Zhu Z. , Chan K.C. , Issaq H.J. , Dimitrov D.S. , Veenstra T.D.
J. Proteome Res.6:4150-4162(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Kinase-selective enrichment enables quantitative phosphoproteomics of the kinome across the cell cycle."
Daub H. , Olsen J.V. , Bairlein M. , Gnad F. , Oppermann F.S. , Korner R. , Greff Z. , Keri G. , Stemmann O. , Mann M.
Mol. Cell31:438-448(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"A quantitative atlas of mitotic phosphorylation."
Dephoure N. , Zhou C. , Villen J. , Beausoleil S.A. , Bakalarski C.E. , Elledge S.J. , Gygi S.P.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.105:10762-10767(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Lys-N and trypsin cover complementary parts of the phosphoproteome in a refined SCX-based approach."
Gauci S. , Helbig A.O. , Slijper M. , Krijgsveld J. , Heck A.J. , Mohammed S.
Anal. Chem.81:4493-4501(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Quantitative phosphoproteomic analysis of T cell receptor signaling reveals system-wide modulation of protein-protein interactions."
Mayya V. , Lundgren D.H. , Hwang S.-I. , Rezaul K. , Wu L. , Eng J.K. , Rodionov V. , Han D.K.
Sci. Signal.2:RA46-RA46(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Quantitative phosphoproteomics reveals widespread full phosphorylation site occupancy during mitosis."
Olsen J.V. , Vermeulen M. , Santamaria A. , Kumar C. , Miller M.L. , Jensen L.J. , Gnad F. , Cox J. , Jensen T.S. , Nigg E.A. , Brunak S. , Mann M.
Sci. Signal.3:RA3-RA3(2010) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"Initial characterization of the human central proteome."
Burkard T.R. , Planyavsky M. , Kaupe I. , Breitwieser F.P. , Buerckstuemmer T. , Bennett K.L. , Superti-Furga G. , Colinge J.
BMC Syst. Biol.5:17-17(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]

"System-wide temporal characterization of the proteome and phosphoproteome of human embryonic stem cell differentiation."
Rigbolt K.T. , Prokhorova T.A. , Akimov V. , Henningsen J. , Johansen P.T. , Kratchmarova I. , Kassem M. , Mann M. , Olsen J.V. , Blagoev B.
Sci. Signal.4:RS3-RS3(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract]